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2D-ddcc.exe (Linux version) is compile in linux 64 environment. Ubuntu 16.04 is the compiled environment. 
similar to windows version. In the terminal windows, simply type 

 2D-ddcc.exe Project_name.inp

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取自 "http://yrwu-wk.ee.ntu.edu.tw/mediawiki/index.php/2D-ddcc.exe_(Linux_version)"