檢視 Jobexample.sh 的原始碼

一般submission 使用標準standard

 #!/bin/bash
 #SBATCH --job-name=Vpit-1
 #SBATCH --nodes=1
 #SBATCH --ntasks=1
 #SBATCH --cpus-per-task=4
 #SBATCH --mem=10g
 #SBATCH --time=24:00:00
 #SBATCH --nice=0
 #SBATCH --partition=standard
 #SBATCH --account=default
 #SBATCH --output=/home/xxxx/job/2D-DDCC/slurm-%j.out
 #SBATCH --error=/home/xxxx/job/2D-DDCC/slurm-%j.err
 cd /home/xxxx/job/2D-DDCC/
 export MKL_NUM_THREADS=4
 export OMP_NUM_THREADS=4
 2D-ddcc.exe inputfile.inp
 wait

Please save it as the job.sh, then type the following commands to submit the job
 sbatch job.sh 
query job
 squeue
cancel job
 scancel jobid 

More detail: [[How to submit job]] <br> 
 
For Quantum Expresso
 
 #!/bin/bash
 #SBATCH --job-name=DFT
 #SBATCH --partition=long
 #SBATCH --nodes=1
 #SBATCH --ntasks-per-node=64
 #SBATCH --cpus-per-task=1
 #SBATCH --account=default
 #SBATCH --mem=300G      # 很重要 這是全部的記憶體 超過就會被砍掉 這個CASE 每個CORE會分配 300/64 
 #SBATCH --mem-per-cpu=4G     # 很重要 配置每個task使用記憶體最多不超過4G 超過會被刪掉 上下兩個選一個使用
 #SBATCH --time=900:00:00
 #SBATCH --nice=15
 #SBATCH --output=/home/xxxxx/DFT/DFT_2023_Tutorial/Material/WSSe/slurm-%j.out
 #SBATCH --error=/home/xxxxx/DFT/DFT_2023_Tutorial/Material/WSSe/slurm-%j.err
 cd /home/xxxxx/DFT/DFT_2023_Tutorial/Material/WSSe/
 export OMP_NUM_THREADS=1          # #SBATCH --cpus-per-task=1 OMP_NUM_THREADS=1   , --cpus-per-task=4 OMP_NUM_THREADS=4
 export OMPI_MCA_btl="self,vader"     # 不要使用infini band 直接使用share memory 
 # 禁用複雜的 single-copy 機制（預設是 mmap，可能吃更多記憶體）
 export OMPI_MCA_btl_vader_single_copy_mechanism=none
 # 減少 eager 傳輸 buffer 大小，避免爆 RAM（32KB 是個穩定值）
 export OMPI_MCA_btl_vader_eager_limit=32768
 #export OMPI_MCA_btl_base_warn_component_unused=0    # 或是使用這兩個取代 export OMPI_MCA_btl="self,vader,tcp"
 #export OMPI_MCA_btl="^openib"
 /home/xxxxx/DFT/QE/mpi/bin/mpirun -n 64 /home/xxxxx/DFT/QE/QE6.7/bin/pw.x < scf02.in > scf02.out
 sleep 20
 /home/xxxxx/DFT/QE/mpi/bin/mpirun -n 64 /home/xxxxx/DFT/QE/QE6.7/bin/pw.x < bands02.in > bands02.out
 sleep 20
 /home/xxxxx/DFT/QE/mpi/bin/mpirun -n 64 /home/xxxxx/DFT/QE/QE6.7/bin/bands.x < bands_pp02.in > bands_pp02.out
 sleep 10
 wait




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[[jobexample.sh]] <br>
[[How to submit job]] <br> 
[[related commands]] <br>